MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Blattabacterium sp. (Blattella germanica) str. Bge plasmid pBge

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015679	AACA	2	8	3	10	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015679	TAA	2	6	22	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015679	A	6	6	30	35	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015679	TGT	2	6	61	66	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015679	AAT	2	6	67	72	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015679	TTCT	2	8	75	82	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015679	A	11	11	83	93	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015679	A	7	7	156	162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015679	CTT	2	6	186	191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015679	A	7	7	203	209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015679	ATT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015679	AT	3	6	302	307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015679	AGA	2	6	312	317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015679	AGA	2	6	320	325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015679	AAGT	2	8	328	335	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015679	TTA	2	6	346	351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015679	TCA	2	6	368	373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015679	AATA	2	8	374	381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015679	ATA	4	12	379	390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015679	A	8	8	418	425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015679	A	8	8	441	448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015679	TTTCT	2	10	452	461	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015679	TC	3	6	492	497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015679	GAA	2	6	536	541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015679	AGA	2	6	558	563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015679	GTT	2	6	598	603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015679	GTT	2	6	625	630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015679	TATCAG	2	12	638	649	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015679	ATT	2	6	658	663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015679	ATC	2	6	684	689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015679	ATG	2	6	695	700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015679	A	7	7	701	707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015679	T	6	6	741	746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015679	T	9	9	759	767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015679	T	8	8	777	784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015679	AATA	2	8	792	799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015679	TG	3	6	809	814	0 %	50 %	50 %	0 %	336478155
38	NC_015679	ATC	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336478155
39	NC_015679	T	6	6	897	902	0 %	100 %	0 %	0 %	336478155
40	NC_015679	A	8	8	903	910	100 %	0 %	0 %	0 %	336478155
41	NC_015679	GAAA	2	8	931	938	75 %	0 %	25 %	0 %	336478155
42	NC_015679	TTTA	2	8	954	961	25 %	75 %	0 %	0 %	336478155
43	NC_015679	TCA	2	6	1017	1022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336478155
44	NC_015679	GA	3	6	1073	1078	50 %	0 %	50 %	0 %	336478155
45	NC_015679	TAT	2	6	1085	1090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336478155
46	NC_015679	CTT	2	6	1109	1114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336478155
47	NC_015679	TTG	2	6	1115	1120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336478155
48	NC_015679	ACA	2	6	1163	1168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336478155
49	NC_015679	A	6	6	1182	1187	100 %	0 %	0 %	0 %	336478155
50	NC_015679	TAAA	2	8	1191	1198	75 %	25 %	0 %	0 %	336478155
51	NC_015679	TCT	2	6	1203	1208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336478156
52	NC_015679	AAT	2	6	1234	1239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336478156
53	NC_015679	TA	3	6	1250	1255	50 %	50 %	0 %	0 %	336478156
54	NC_015679	T	7	7	1299	1305	0 %	100 %	0 %	0 %	336478156
55	NC_015679	T	10	10	1395	1404	0 %	100 %	0 %	0 %	336478156
56	NC_015679	T	7	7	1421	1427	0 %	100 %	0 %	0 %	336478156
57	NC_015679	TCT	2	6	1455	1460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336478156
58	NC_015679	T	6	6	1469	1474	0 %	100 %	0 %	0 %	336478156
59	NC_015679	ATTT	2	8	1528	1535	25 %	75 %	0 %	0 %	336478156
60	NC_015679	AAT	2	6	1553	1558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336478156
61	NC_015679	TTA	2	6	1569	1574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336478156
62	NC_015679	AGA	2	6	1587	1592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336478156
63	NC_015679	T	7	7	1622	1628	0 %	100 %	0 %	0 %	336478156
64	NC_015679	ATA	2	6	1632	1637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336478156
65	NC_015679	GTA	2	6	1653	1658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336478156
66	NC_015679	TCA	2	6	1666	1671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336478156
67	NC_015679	T	6	6	1673	1678	0 %	100 %	0 %	0 %	336478157
68	NC_015679	CTT	2	6	1704	1709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336478157
69	NC_015679	AGA	2	6	1714	1719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336478157
70	NC_015679	TATT	2	8	1755	1762	25 %	75 %	0 %	0 %	336478157
71	NC_015679	T	6	6	1775	1780	0 %	100 %	0 %	0 %	336478157
72	NC_015679	TTTTA	2	10	1795	1804	20 %	80 %	0 %	0 %	336478157
73	NC_015679	T	6	6	1831	1836	0 %	100 %	0 %	0 %	336478157
74	NC_015679	TAA	2	6	1887	1892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336478157
75	NC_015679	TTC	2	6	1911	1916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336478157
76	NC_015679	AAT	2	6	1968	1973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336478157
77	NC_015679	CAA	2	6	1990	1995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336478157
78	NC_015679	A	6	6	2009	2014	100 %	0 %	0 %	0 %	336478157
79	NC_015679	A	7	7	2049	2055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015679	CTTATT	2	12	2064	2075	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015679	TA	3	6	2077	2082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015679	T	6	6	2125	2130	0 %	100 %	0 %	0 %	336478158
83	NC_015679	T	9	9	2154	2162	0 %	100 %	0 %	0 %	336478158
84	NC_015679	GAA	2	6	2183	2188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336478158
85	NC_015679	A	6	6	2187	2192	100 %	0 %	0 %	0 %	336478158
86	NC_015679	A	7	7	2245	2251	100 %	0 %	0 %	0 %	336478158
87	NC_015679	TGT	2	6	2258	2263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336478158
88	NC_015679	TA	3	6	2278	2283	50 %	50 %	0 %	0 %	336478158
89	NC_015679	CT	3	6	2344	2349	0 %	50 %	0 %	50 %	336478158
90	NC_015679	T	6	6	2381	2386	0 %	100 %	0 %	0 %	336478158
91	NC_015679	TCT	2	6	2390	2395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336478158
92	NC_015679	T	6	6	2395	2400	0 %	100 %	0 %	0 %	336478158
93	NC_015679	TAG	2	6	2403	2408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336478158
94	NC_015679	T	6	6	2453	2458	0 %	100 %	0 %	0 %	336478158
95	NC_015679	TTC	2	6	2488	2493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336478158
96	NC_015679	T	6	6	2501	2506	0 %	100 %	0 %	0 %	336478158
97	NC_015679	TCA	2	6	2519	2524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336478158
98	NC_015679	A	6	6	2583	2588	100 %	0 %	0 %	0 %	336478158
99	NC_015679	TGT	2	6	2594	2599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336478158
100	NC_015679	AGA	2	6	2650	2655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336478158
101	NC_015679	GCA	3	9	2675	2683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336478158
102	NC_015679	CT	3	6	2713	2718	0 %	50 %	0 %	50 %	336478158
103	NC_015679	ATTGT	2	10	2719	2728	20 %	60 %	20 %	0 %	336478158
104	NC_015679	TTG	2	6	2775	2780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336478158
105	NC_015679	TCT	2	6	2786	2791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336478158
106	NC_015679	A	6	6	2792	2797	100 %	0 %	0 %	0 %	336478158
107	NC_015679	ATC	2	6	2806	2811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336478158
108	NC_015679	TAAG	2	8	2830	2837	50 %	25 %	25 %	0 %	336478158
109	NC_015679	CAT	2	6	2884	2889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336478158
110	NC_015679	GAA	2	6	3005	3010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336478158
111	NC_015679	ATTT	2	8	3046	3053	25 %	75 %	0 %	0 %	336478158
112	NC_015679	TGT	2	6	3077	3082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336478158
113	NC_015679	AAT	2	6	3090	3095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336478158
114	NC_015679	T	7	7	3153	3159	0 %	100 %	0 %	0 %	336478158
115	NC_015679	TAAAA	2	10	3185	3194	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015679	A	7	7	3198	3204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015679	CG	3	6	3240	3245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015679	CG	3	6	3271	3276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015679	CG	3	6	3302	3307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015679	CG	3	6	3333	3338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015679	CG	3	6	3364	3369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015679	CG	3	6	3395	3400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015679	CG	3	6	3426	3431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015679	CG	3	6	3457	3462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015679	CG	3	6	3488	3493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015679	CG	3	6	3519	3524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015679	CG	3	6	3550	3555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015679	CG	3	6	3581	3586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015679	CG	3	6	3612	3617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015679	CG	3	6	3643	3648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015679	CGGG	3	12	3672	3683	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_015679	TAA	2	6	3715	3720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015679	TAAA	2	8	3747	3754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015679	ATT	2	6	3757	3762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015679	TA	7	14	3769	3782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015679	T	7	7	3787	3793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015679	A	6	6	3797	3802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015679	TTC	2	6	3806	3811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015679	C	10	10	3841	3850	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
140	NC_015679	C	10	10	3855	3864	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
141	NC_015679	A	10	10	3901	3910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015679	TA	3	6	3930	3935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015679	AT	3	6	4080	4085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.